Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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MRPL28Q13084 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MRPL28Q13084 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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