Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BPTFQ12830 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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