Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
OTUD4Q01804 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms