Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAA2P54646 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms