Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRPC1P48995 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms