Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms