Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SIX3O95343 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms