Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms