Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HACD1B0YJ81 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD1B0YJ81 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms