Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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