Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRRM3A6NNA2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms