Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC160A6NGH7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC160A6NGH7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms