Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HMX2A2RU54 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms