Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC12A4Q9UP95 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms