Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DKK2Q9UBU2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms