Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MED17Q9NVC6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms