Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COMMD5Q9GZQ3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms