Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RPUSD4Q96CM3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RPUSD4Q96CM3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RPUSD4Q96CM3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RPUSD4Q96CM3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPUSD4Q96CM3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4Q96CM3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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