Protein–RNA interactions for Protein: Q86W56

PARG, Poly(ADP-ribose) glycohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARGQ86W56 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARGQ86W56 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms