Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL2Q6F5E8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms