Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A12Q504Y0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms