Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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