Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms