Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR1H3Q13133 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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