Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEUP1Q05D60 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms