Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms