Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XCR1P46094 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms