Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNA1P35221 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNA1P35221 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms