Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MSX1P28360 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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MSX1P28360 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MSX1P28360 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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