Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYNP07948 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYNP07948 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYNP07948 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms