Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPBP07199 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPBP07199 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms