Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN7O94888 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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