Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRIT2A6NDA9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms