Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms