Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms