Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPAS2Q99743 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms