Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00208Q96KT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms