Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms