Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECM1Q16610 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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