Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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