Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIP13Q15645 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIP13Q15645 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms