Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAPSNQ13702 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms