Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTCH1Q13635 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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