Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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