Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SGCGQ13326 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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