Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MRPL28Q13084 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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MRPL28Q13084 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MRPL28Q13084 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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