Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNIP1Q12981 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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