Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUCB1Q02818 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms