Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX1P78337 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX1P78337 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PITX1P78337 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX1P78337 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms