Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DDIT3P35638 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDIT3P35638 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms